Птицы (Aves) – самый многочисленный по видовому составу класс позвоночных животных Таджикистана. Здесь встречается 346 видов относящихся к 16 отрядам. По характеру пребывания они распределяются на оседлых, перелетно-гнездящихся, пролётных, зимующих и залётных. Птицы распространены во всех экосистемах и, многие их представители являются фоновыми. Более 10% (37 видов) птиц относятся к категории редких или находящихся под угрозой исчезновения. В самом критическом положении находятся соколиные и дрофы. В республике имеют место случаи незаконного отлова соколиных с целью вывоза за пределы страны.
Оседлые птицы составляют 82 вида, гнездящиеся – 150, пролетные – 108, зимующие – 80 и залетные – 21 вид. Среди водоплавающих и околоводных птиц важное охотничье-промысловое значение имеют более 20 видов, зимующих в водно-болотных угодьях, водохранилищах, озерах, искусственных прудах и реках. К охотничьим относятся также представители отряда куриных (Galliformes) – кеклик (Alectoris kakelik), перепел (Coturnix coturnix), тибетский улар (Tetraogallus tibetanus), фазан (Phasianus colchicus).
Основными местами гнездования птиц в условиях Таджикистана являются долины рек, пойменные заросли кустарников и травянистых сообществ, горные леса и горные озера, реже – луга и степи.
Значительная часть видов птиц гнездится на верхних отрогах гор Северного, Центрального Таджикистана и Бадахшана. Орнитофауна Восточного Памира резко отличается по численности и видовому составу.
Отряд Поганкообразные (Podicipedi-formes) представлен 3 видами. Большая поганка (Podiceps cristatus) зимует, бывает на пролете и гнездовье в водоемах Юго-Западного Таджикистана. Малая поганка (Podiceps ruficollis) – оседлый вид, распространена в водоемах Юго-Западного и Центрального Таджикистана. Черношейная поганка (Podiceps caspicus) является редкой, на пролете встречается в водоемах равнинной зоны Таджикистана.
Отряд Веслоногие (Pelecaniforrnes) насчитывает 4 вида. Большой баклан (Phalacrocorax carbo sinensis) зимует, бывает на пролете, а отдельные особи могут встречаться все лето. Его распространение охватывает большую часть территории Таджикистана, включая высокогорные озера Памира. Малый баклан (Phalacrocorax pygmaeus) – наиболее массовый вид среди зимующих водоплавающих птиц Южного Таджикистана.
Отряд Голенастые (Ciconiiformes) включает 12 видов. Белый и черный аисты (Ciconia ciconia asiatica и Ciconia nigra) – пролетно-гнездящиеся птицы, занесены в Красную книгу Таджикистана. Основными причинами сокращения их ареала и численности являются освоение пойменных земель и фактор беспокойства. Белая и серая цапли (Egretta alba alba и Ardea cinerea) по характеру пребывания являются зимующими пролетными, а также гнездящимися. Малая выпь (Ixobrychus minutus minitus) – пролетно-гнездящаяся птица, встречается в низинных частях Северного и Юго-Западного Таджикистана.
Отряд Пластинчатоклювые (Anseri-formes) представлен 25 видами. Горный гусь (Anser indicus) занесен в Красную Книгу Таджикистана. В настоящее время в результате браконьерства и разорения гнезд численность горного гуся резко сократилась, гнездовья сохранились только на островах и берегах озер Восточного Памира – Каракуля, Рангкуля и Зоркуля. В связи с созданием Зоркульского заповедника популяции горного гуся на этой территории взяты под охрану.
Отряд хищные птицы (Falconiformes) – включает 35 видов, 11 из них занесены в Красную Книгу. Из семейства ястребиных (Accipitridae) орел-бородач (Dypaetus barbatus hemachalanus) гнездится на хребтах, высотой 1400-1800 м над ур. моря, совершает сезонные вертикальные перемещения. Стервятник (Neophron percenopterus) – редкая, малочисленная птица. Обитает в предгорьях и в среднем поясе гор. По Пянджу поднимается до Калай-Хумба, Рушана и Хорога. Гнездится на высоте 1800-2000 м над ур. моря. Занесен в Красную книгу Таджикистана. Орёл-беркут (Aguila chrysaetus laphanea) – гнездится на скалах, является осёдлой птицей, осуществляет сезонные вертикальные миграции.
Отряд куриные (Galliformes) – представлен 7 видами, из них 4 вида занесены в Красную книгу. Наиболее редким ценным видом является пустынная куропатка (Ammoperdix griseogularis), распространенная в юго-западной части республики. Бородатая куропатка (Perdix daurica turcamona) – оседлый вид, распространена на северных склонах Туркестанского хребта. Гнездится на высоте 1200-2200 м над ур. моря. Другой очень редкий и малочисленный, внесенный в Красную книгу Таджикистана вид – тибетский улар (Tetraogallus tibetanus), включен в категорию видов, находящихся под угрозой исчезновения. Это типично высокогорная птица.
Фазан (Phasianus colchicus) в Таджикистане образует 3 подвида: черно-золотистый или таджикский (Ph.c.bianchii), зеравшанский (Ph.c.serafshanicus tarn) и сырдарьинский (Ph.c.turkestanicus forens). Все три подвида занесены в Красную книгу Таджикистана.
Отряд журавлеобразные (Gruiformes) – включает 13 видов, из них 2 вида из семейства дрофиных (Otididae) внесены в Красную книгу Таджикистана. Дрофа (Otis tarda tarda) встречается в Таджикистане на зимовке. Отнесена к категории редких, находится на грани исчезновения.
Отряд ржанкообразные (Charadrii-formes) – представлен 51 видами, из которых 5 видов внесены в Красную книгу. Серпоклюв (Ibidorhyncha struthetrsi) – очень редкий, сокращающийся в численности вид. Отнесён к категории птиц, находящихся под угрозой исчезновения. Встречаются зимующие популяции, редко гнездится. Общая численность серпоклюва в Таджикистане не более 30 пар. Относится к числу оседлых птиц, совершающих сезонные миграции. Вертикальное распространение охватывает высоты 1600-3500 м над ур. моря. Внесен в Красную книгу Таджикистана.
Отряд голубеобразные (Columbi-formes) – включает 12 видов. Представители этого отряда имеют широкое распространение по всей территории Республики. В Красную книгу Таджикистана внесены 3 вида: белогрудый голубь (Columba leuconota) – редкий, узкоареальный вид, встречается на Памире; чернобрюхий рябок (Pterocles orientalis orena-rius) – малочисленный исчезающий вид; тибетская саджа (Syrrhaptes tibetana) – является исчезающим видом; вяхирь (Columba palumbus casiotis) – занесен в Красную книгу Таджикистана, населяет арчовые и широколиственные горные леса, занимает высоты 1200-3000 м над ур. моря, гнездится на деревьях.
Отряд кукушкообразные (Cuculiformes) – представлен 2 видами: обыкновенная (Cuculus canorus) и глухая (C.saturolas) кукушки. Являются пролетными и редкими по численности птицами.
Отряд совы (Strisiformes) – представлен 8 видами. Представители этого отряда имеют довольно широкое распространение. Гнездятся в горах и низинных районах; встречаются в пролете. Типичным представителем является филин (Bubo bubo omissus).
Отряд козодоеобразные (Caprimulgi-formes) – представлен 2 видами: обыкновенный козодой (Caprimulgus europaeus sarudnyi) и буланый козодой (Caprimulgus aegyptius arenicolor sev). Эти виды в Таджикистане пролетные и гнездящиеся.
Отряд ракшеобразные (Coraciiformes) – включает 5 видов: зимородок (Alcedo atthis atthis), золотистая (Merops apiasterp) и зеленая щурки (Merops superciliosus persicus), сизоворонка (Coracias garrulus semenowi), удод (Upupa epops epops). Все они пролетные и гнездящиеся в низкогорье и высогорье.
Отряд стрижеобразные (Apodiformes) – представлен 3 видами. Белобрюхий стриж (Apus melba tuneti) и черный стриж (A.apus pekinensis swinhoe) перелетные, гнездятся в низкогорной части Памиро-Алая. Малый стриж (A.affinis galibejensis) внесен в Красную книгу Таджикистана.
Отряд дятлообразные (Piciformes) – включает 2 вида. Белокрылый дятел (Dendrocopos leucopterus) довольно широко распространен на гнездовье в пределах Памиро-Алая, вертишейка (Jynx torguilla) на Памиро-Алае встречается только на пролете.
Отряд воробьиные (Passerioformes) – включает 163 вид. 7 видов внесены в Красную книгу Таджикистана: кустарница (Carrulax lineatus), райская мухоловка (Terpsiphone paradisi), рыжехвостая мухоловка (Muscicapa ruficauda), белоножка (Microcichla scouleri), белошапочная (водная) горихвостка (Chaimar-rornis leucocephala), синяя птица (Myophonus caeruleus), расписная синица (Leptopoecile sophia).
Осенью из северных широт в Таджикистан на зимовку прилетают более 80 видов пернатых и, находя здесь оптимальные условия существования, остаются до самой поздней весны. Наиболее многочисленную группу зимующих птиц составляют водоплавающие и околоводные виды. Водоемы Таджикистана привлекают большие стаи чаек (Larus), крачек (Corvus), кулик-воробьев (Caltris), бакланов (Phalacrocorax). Следует отметить, что территория Таджикистана считается одним из основных коридоров миграции птиц на Азиатской части континента. Именно через горные системы Таджикистана проходят пути миграции сотен видов птиц.